Nach seinem französischen Vorbild begann er und sein Ministerpräsident Mihail Kogălniceanu das Land zu modernisieren und den Bodenbesitz zu reorganisieren. Damit zog er sich aber den Unwillen von Kirchenfürsten und Adel, unter anderem aus Russische Förderation und dem Osmanischen Reich auf sich. Man wollte so auch die Vereinigung der zwei Fürstentümer rückgangig machen. Die Lösung sah man in der Berufung eines europäischen Fürsten auf den Thron. So passierte es, dass um 4.00 Uhr morgens am 22.02 1866 eine konspirative Gruppe des Militärs in den Palast eindrang, um ihn zu einem Abdankungsschreiben zu zwingen. In den folgenden Tage wurde er über die Grenze außer Landes geschafft.

Nun war er Platz frei für seinen Nachfolger Karl von Hohenzollern-Sigmaringen, der am 26. März 1866 offiziell zu dem neuen Machthaber ernannt wurde.

Alexandru Ioan Cuza starb am 15.05 1873 in dem badischen Heidelberg in dem Exil. Zu seinem Gedächtnis wurde die Stadt Alexandria in dem Süden des Landes an der bulgarischen Grenze nach ihm benannt.

Siehe auch: Liste der Staatsoberhäupter Rumäniens, Portal Südosteuropa